Joaquín Villalobos fue jefe político y militar del Ejército Revolucionario del Pueblo, uno de cinco grupos que integraron el Frente Farabundo Martí durante la guerra civil salvadoreña entre 1979 y 1992.
Adicionalmente fue signatario del acuerdo de paz entre el gobierno de El Salvador y el Frente Farabundo Martí, firmado en México el 16 de enero de 1992, acabando con 13 años de conflicto interno.
Se ha desempeñado como investigador en temas de reconciliación, gobernabilidad y seguridad para University of Oxford, Universidad de Alcalá (España), el Centro de Estudios e Investigaciones Internacionales en París, y el Centro de Investigaciones Económicas en México.
Ha participado en discusiones sobre seguridad, resolución de conflictos y transición democrática en l'Université Paris-Sorbonne, London School of Economics, University of Oxford, Universidad de Oviedo (España), Universidad de Alcalá (España), U.S Army War College-Carlisle (EE.UU), Georgetown University, George Washington University, Yale University, y University of Southern California.
Ha dictado conferencias en temas de resolución de conflictos en Irlanda, Bosnia y Sri Lanka junto a Tufts University, en Afganistán junto a York University, en Filipinas junto a las Naciones Unidas, y se ha desempeñado como asesor en seguridad para los gobiernos de Colombia, México y El Salvador.
Ha sido conferencista en foros internacionales como la Cumbre Internacional sobre Democracia, Terrorismo y Seguridad de Madrid (2005), el Programa Mundial de Alimentos de las Naciones Unidas y la CEPAL en Santiago de Chile (2010), y la Conferencia de Seguridad en Centroamérica del Banco Mundial y el Gobierno de México (2010).
Ha publicado artículos y ensayos en El País (España), Le Monde (Francia), El Tiempo y Revista Semana (Colombia), Revista Nexos (México), Por Esto (Venezuela), El Diario de Hoy y Prensa Gráfica (El Salvador), Foreign Policy y Foreign Affairs, entre otras.
Joaquín Villalobos cuenta con un título en Ciencias Sociales de la Universidad de El Salvador y una maestría en Políticas Públicas de University of Oxford. Actualmente se desempeña como asesor para el proceso de paz en Colombia y como conferencista permanente del Diplomado en Inteligencia del Instituto Tecnológico de Monterrey.
